Набор Oncomine™ Pan‑Cancer Cell‑Free, 8 реакций(A37664)
Арт. A37664
Характеристики
Тип товара
—
Реагенты
Единица измерения
—
наб.
Набор Oncomine™ Pan‑Cancer Cell‑Free, 8 реакций(A37664)
Арт. A37664
Анализ Oncomine Pan-Cancer Cell-Free является частью комплексного решения для обнаружения множественных мишеней в ДНК и РНК, полученных из опухолей, выделенных из плазменной фракции цельной крови. Анализ предоставляет реагенты и единый пул мультиплексных ПЦР-праймеров для подготовки библиотеки ампликонов из бесклеточной общей нуклеиновой кислоты (cfTNA), полученной из плазменной фракции одной 10-мл пробирки цельной крови. Затем эту библиотеку можно использовать для высокомультиплексного целевого секвенирования следующего поколения (NGS).
Преимущества бесклеточного анализа Oncomine:
• Из одной пробирки крови создается библиотека ампликонов как из ДНК, так и из РНК с пределом обнаружения 0,1% для SNV
• Размер ампликона оптимизирован для короткой cfDNA, что обеспечивает максимально возможную скорость захвата
• Технология секвенирования меток сводит к минимуму ложноположительные результаты за счет удаления случайно включенных ошибок
• Оптимизированный дизайн целевого анализа позволяет проводить высокомультиплексный NGS, что снижает затраты на секвенирование на образец
• Двухдневный рабочий процесс от одной 10-мл пробирки крови до отчета; Общее время до целевых библиотек составляет всего четыре часа
• Позволяет проводить генетические исследования рака всего из 5 нг входного cfTNA
• Совместимо с образцами FFPE для возможных исследований соответствия
Панель из 52 генов включает:
• Гены горячих точек (SNV) и короткие инсерции: AKT1, ALK, AR, ARAF, BRAF, CHEK2, CTNNB1, DDR2,EGFR, ERBB2, ERBB3, ESR1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, GNA11, GNAQ, GNAS, HRAS, IDH1, IDH2, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MTOR, NRAS, NTRK1, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, RET, ROS1, SF3B1, SMAD4, SMO
• Ген слияния: ALK, BRAF, ERG, ETV1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NTRK1, NTRK3, RET, ROS1
• Пропуск экзона 14 MET
• Гены числа копий (CNV): CCND1, CCND2, CCND3, CDK4, CDK6, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, MYC
• Гены-супрессоры опухолей: APC, FBXW7, PTEN, TP53
Было установлено, что эти гены часто мутируют при различных типах рака, включая: мочевой пузырь, мозг и ЦНС, молочную железу, шейку матки, колоректальный рак, эндометрий, пищевода, желудка, головы и шеи, почки, печени, легких, меланому, яичники, поджелудочная железа, предстательная железа, саркому и щитовидную железу.
Пределы обнаружения:
• SNV/короткие индели: предел обнаружения (LOD) до 0,1% частоты аллеля (AF) может быть достигнут с чувствительностью >80% и специфичностью >98%*
• SNV/индели всей мишени TP53: 0,5% AF (рассматривая все основания в ампликонах)
• Слияния и пропуск экзонов MET: может быть достигнут LOD до 1%
• Цели CNV: может быть достигнуто обнаружение всего лишь 1,4-кратного изменения
Набор для выделения нуклеиновых кислот без клеток MagMAX (A36716) настоятельно рекомендуется для выделения как ДНК, так и РНК из фракции плазмы цельной крови.
Масштабируемость и гибкость достигаются с помощью набора штрихкодов Tag Sequencing Barcode Set 1-24 или 25-48 (кат. № A31830 и A31847 соответственно) для мультиплексирования штрихкодированных образцов на чипах Ion S5.
Анализ SNV и коротких инделей может быть выполнен с помощью программного обеспечения Torrent Suite 5.2 или выше. Для анализа SNV, коротких инделей, слияний и CNV требуется программное обеспечение Ion Reporter 5.6 (облачное или серверное).
Технология
cfDNA и cfRNA обнаруживаются в чрезвычайно низких концентрациях в плазме цельной крови. Из-за этой низкой распространенности в этом анализе используется технология секвенирования тегов. Технология прикрепляет уникальные молекулярные теги к геноспецифичным праймерам. После амплификации меченые молекулы группируются на основе тегов. Группы, содержащие один и тот же мутантный вариант в 80% случаев или больше, будут называться положительными. Используя эту технологию тегов, удаляются группы, содержащие случайные ошибки, полученные в процессе построения библиотеки/секвенирования.
В отличие от других технологий с LOD 1-5%, Oncomine Pan-Cancer Cell-Free Assay имеет гибкий предел обнаружения до 0,1% для SNV или 1 мутантной копии на фоне 1000 копий дикого типа. Для достижения LOD 0,1% требуется 20 нг входного cfTNA. Можно использовать меньшие количества cfTNA, но %LOD будет выше в зависимости от входного количества. Жидкие
биопсии имеют несколько преимуществ по сравнению с обычными биопсиями солидных опухолей:
• Образцы жидкой биопсии менее инвазивны, что позволяет брать их в несколько временных точек для мониторинга прогрессирования рака
• Более низкая стоимость по сравнению с традиционными биопсиями тканей
• Более быстрое время выполнения от образца до результатов
• Лучше отражает гетерогенность опухоли
Преимущества бесклеточного анализа Oncomine:
• Из одной пробирки крови создается библиотека ампликонов как из ДНК, так и из РНК с пределом обнаружения 0,1% для SNV
• Размер ампликона оптимизирован для короткой cfDNA, что обеспечивает максимально возможную скорость захвата
• Технология секвенирования меток сводит к минимуму ложноположительные результаты за счет удаления случайно включенных ошибок
• Оптимизированный дизайн целевого анализа позволяет проводить высокомультиплексный NGS, что снижает затраты на секвенирование на образец
• Двухдневный рабочий процесс от одной 10-мл пробирки крови до отчета; Общее время до целевых библиотек составляет всего четыре часа
• Позволяет проводить генетические исследования рака всего из 5 нг входного cfTNA
• Совместимо с образцами FFPE для возможных исследований соответствия
Панель из 52 генов включает:
• Гены горячих точек (SNV) и короткие инсерции: AKT1, ALK, AR, ARAF, BRAF, CHEK2, CTNNB1, DDR2,EGFR, ERBB2, ERBB3, ESR1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FLT3, GNA11, GNAQ, GNAS, HRAS, IDH1, IDH2, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MTOR, NRAS, NTRK1, NTRK3, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, RET, ROS1, SF3B1, SMAD4, SMO
• Ген слияния: ALK, BRAF, ERG, ETV1, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NTRK1, NTRK3, RET, ROS1
• Пропуск экзона 14 MET
• Гены числа копий (CNV): CCND1, CCND2, CCND3, CDK4, CDK6, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, MYC
• Гены-супрессоры опухолей: APC, FBXW7, PTEN, TP53
Было установлено, что эти гены часто мутируют при различных типах рака, включая: мочевой пузырь, мозг и ЦНС, молочную железу, шейку матки, колоректальный рак, эндометрий, пищевода, желудка, головы и шеи, почки, печени, легких, меланому, яичники, поджелудочная железа, предстательная железа, саркому и щитовидную железу.
Пределы обнаружения:
• SNV/короткие индели: предел обнаружения (LOD) до 0,1% частоты аллеля (AF) может быть достигнут с чувствительностью >80% и специфичностью >98%*
• SNV/индели всей мишени TP53: 0,5% AF (рассматривая все основания в ампликонах)
• Слияния и пропуск экзонов MET: может быть достигнут LOD до 1%
• Цели CNV: может быть достигнуто обнаружение всего лишь 1,4-кратного изменения
Набор для выделения нуклеиновых кислот без клеток MagMAX (A36716) настоятельно рекомендуется для выделения как ДНК, так и РНК из фракции плазмы цельной крови.
Масштабируемость и гибкость достигаются с помощью набора штрихкодов Tag Sequencing Barcode Set 1-24 или 25-48 (кат. № A31830 и A31847 соответственно) для мультиплексирования штрихкодированных образцов на чипах Ion S5.
Анализ SNV и коротких инделей может быть выполнен с помощью программного обеспечения Torrent Suite 5.2 или выше. Для анализа SNV, коротких инделей, слияний и CNV требуется программное обеспечение Ion Reporter 5.6 (облачное или серверное).
Технология
cfDNA и cfRNA обнаруживаются в чрезвычайно низких концентрациях в плазме цельной крови. Из-за этой низкой распространенности в этом анализе используется технология секвенирования тегов. Технология прикрепляет уникальные молекулярные теги к геноспецифичным праймерам. После амплификации меченые молекулы группируются на основе тегов. Группы, содержащие один и тот же мутантный вариант в 80% случаев или больше, будут называться положительными. Используя эту технологию тегов, удаляются группы, содержащие случайные ошибки, полученные в процессе построения библиотеки/секвенирования.
В отличие от других технологий с LOD 1-5%, Oncomine Pan-Cancer Cell-Free Assay имеет гибкий предел обнаружения до 0,1% для SNV или 1 мутантной копии на фоне 1000 копий дикого типа. Для достижения LOD 0,1% требуется 20 нг входного cfTNA. Можно использовать меньшие количества cfTNA, но %LOD будет выше в зависимости от входного количества. Жидкие
биопсии имеют несколько преимуществ по сравнению с обычными биопсиями солидных опухолей:
• Образцы жидкой биопсии менее инвазивны, что позволяет брать их в несколько временных точек для мониторинга прогрессирования рака
• Более низкая стоимость по сравнению с традиционными биопсиями тканей
• Более быстрое время выполнения от образца до результатов
• Лучше отражает гетерогенность опухоли
Мы работаем с физическими и юридическими лицами. И предоставляем сразу два варианта оплаты.
- Наличные. Вы подписываете товаросопроводительные документы, расплачиваетесь денежными средствами, получаете товар и чек.
- Безналичный расчет. Принимаем карты Visa и MasterCard. Доступен при курьерской доставке.
Ваш заказ можем доставить собственными ресурсами, при условии вашего нахождения в городе. Либо через 4 варианта доставки:
- Курьерская доставка. Курьерская доставка работает с 9:00 до 19:00. Когда товар поступит на склад, курьерская служба свяжется для уточнения деталей. Специалист предложит выбрать удобное время доставки и уточнит адрес.
- Самовывоз из магазина. Для получения заказа обратитесь к сотруднику в кассовой зоне и назовите номер.
- Сотрудничаем с постаматами. Срок хранения — 3 дня.
- Предоставляем почтовую доставку через почту России. Когда заказ придет в отделение, на ваш адрес придет извещение о посылке. Вскрывать коробку самостоятельно вы можете только после оплаты заказа.