Набор Ion 16S™ Metagenomics Kit предназначен для быстрого, всестороннего и широкополосного анализа смешанных микробных популяций с использованием рабочего процесса полупроводникового секвенирования Ion Torrent™. Набор позволяет проводить ПЦР-амплификацию гипервариабельных участков гена 16S рДНК бактерий. Амплифицированные фрагменты затем можно секвенировать с помощью набора Ion PGM™ Sequencing 400 Kit на платформе Ion PGM™ и анализировать с помощью модуля анализа метагеномики Ion 16S™ в программном обеспечении Ion Reporter™.

Всесторонний

В комплект входят 2 набора праймеров, которые можно использовать для амплификации соответствующих гипервариабельных участков гена 16S рДНК у бактерий:

Набор капсюлей V2-4-8
Набор капсюлей V3-6,7-9
Эти комплексные наборы праймеров позволяют точно обнаруживать и идентифицировать широкий спектр бактерий вплоть до уровня рода или вида. Наборы праймеров сочетаются с Environmental Master Mix v2.0, который оптимизирован для переносимости высоких уровней ингибиторов ПЦР и амплификации целей из сложных образцов, таких как образцы окружающей среды, пищи, тканей и других сложных образцов. Кроме того, набор включает положительный контроль для экспериментов по устранению неполадок.

Гибкий

Наборы праймеров предоставляются в виде двух пулов. Каждый пул может использоваться по отдельности или в комбинации, что обеспечивает гибкость экспериментальной настройки. При сочетании с наборами адаптеров штрихкодов Ion Xpress™ несколько полимикробных образцов могут быть объединены в одном рабочем процессе секвенирования.

Полный рабочий процесс

Последовательности, полученные с помощью набора Ion 16S™ Metagenomics Kit, можно напрямую анализировать с помощью модуля метагеномного анализа Ion 16S™ в программном обеспечении Ion Reporter™, что позволяет проводить быструю и полуколичественную оценку сложных микробных образцов.

Примечание: Этот набор несовместим с набором Ion Library Quantitation Kit (Кат. № 4468802). Для точного количественного определения ампликонов, полученных с помощью этого набора, используйте набор Ion Universal Library Quantitation Kit (Кат. № A26217).