Буфер для образцов NuPAGE LDS содержит Coomassie G250 и Phenol Red в качестве отслеживающих красителей вместо бромфенолового синего. Coomassie G250 дает резкий фронт красителя с рабочими буферами MES и MOPS SDS и мигрирует гораздо ближе к движущемуся ионному фронту, чем бромфеноловый синий. Бромфеноловый синий движется медленнее, чем некоторые пептиды с рабочим буфером MES SDS. Это гарантирует, что небольшие пептиды не вытекут из гелей.